En el año 2020, una nación enfrenta la amenaza omnipresente de los “Otros”, misteriosos monstruos que caen del cielo y se alimentan de cerebros humanos. Al mismo tiempo, se descubre la psiónica, una hormona que otorga a ciertas personas habilidades extrasensoriales efectivas contra los Otros, en el cuerpo humano. Posteriormente, el fundador de la nación establece la Fuerza de Supresión de Otros (OSF) para combatir a estos monstruos y salvar a la humanidad. Comúnmente conocidos como los Guardianes Escarlata, los jóvenes con psiónica se someten a un entrenamiento intensivo para unirse a este grupo.
Un día, la nación prepara una ceremonia de inducción para los reclutas excepcionales que completaron el agotador entrenamiento para convertirse en Guardianes Escarlata. Entre estos jóvenes de élite se encuentra Yuito Sumeragi, el decidido hijo del fundador de la nación; a la edad de cinco años, fue rescatado por una mujer de la OSF
Scarlet Nexus está inspirado en el videojuego de rol de acción japonés desarrollado por Bandai Namco Studios y Tose del mismo nombre. Publicado por Bandai Namco Entertainment, el juego se lanzó justo antes de la emisión de la serie de televisión el 25 de junio de 2021 para Windows, PlayStation 4, Playstation 5, Xbox One y Xbox Series X/S.
