Con informes de monstruos aterrorizando el reactor en el Monte Nibel, Shinra Electric Power Company envía a su fuerza de combate de élite SOLDADO a investigar. Acompañado por su compañero SOLDADO de primera clase Zack Fair y un pequeño contingente de guardias de la compañía, el héroe de guerra Sephiroth debe evaluar el estado del reactor de Mako a instancias de la compañía. En Nibelheim, el pueblo al que alimenta el reactor, Sephiroth descubre la fuente de los monstruos y los orígenes del legendario Proyecto Jenova de Shinra.
Corriendo por el bosque meses después, Zack ya no es el héroe en el que una vez soñó convertirse. Huye del Departamento de Asuntos Generales de Shinra Electric Power Company, más conocidos como los turcos, que buscan desesperadamente enterrar la evidencia que vive dentro de los dos.
